5 копеек
Папку cod, смело не удалять!
Классы? Не пробовал (почему то ещё как то не добирался
) как их использовать в сборках отличных от основывающихся на BAT, зато в БАТе , расположив оные в соответствующем для них месте, очень даже наоборот , можно смело удалять хеши
(Единственно, пожалуй, пересчитать "на пальцах" количество классов в открытом виде и сравнить с количеством хешей- очень даже неплохо чтобы численность совпадала)
P.S. Илы пока не устанавливал, я собсно, в целом касаемо структуры