Лефти, дыры воздухозаборников делаются альфой. Так гораздо легче, это во-первых, и во-вторых - меньше полигонов уходит.
Это раз. Два - я надеюсь, новая модель будет получаться в результате подстановки твоих мешей в стандартную модель И-16? Т.е. изобретений велосипедов не будет?
И последнее, совет как-бы: ты попробуй экспортировать из макса в *.msh не всю модель, а только отдельные меши, мне кажется, так должно получиться.