Лучше вообще вручную распихивать папки модов в нужные места. И проверять на наличие двойников (файлов) обязательно. И смотреть сразу, что и как они изменили. Это еще Скворец советовал не так давно. Полазай по темам-много нужного и интересного найдешь.